Soruşturma kapsamında şüpheli ve sanıklarda 57 ruhsatsız tabanca ele geçirildi. Bu silahlardan biri 7 Ocak 2009'da evi aranan ancak 3. iddianamede sanık olarak yer almayan eski Yargıtay Savcısı Sabih Kanadoğlu'na ait. Kanadoğlu'nun soruşturma kapsamındaki hukukî durumu bilinmiyor; ancak üçüncü iddianamede örgüte ait olduğu iddia edilen silahların sahipleri arasında ismi geçiyor.
Yine Ergenekon soruşturması kapsamında firari şüpheliler Bedrettin Dalan ve Gülseven Yaşer'de de ruhsatsız tabanca bulunmuş. İddianamede, örgütün cephaneliklerinin içinde belirtilen 57 ruhsatsız tabancanın sahipleri arasında birinci iddianamenin sanıklarından Oktay Yıldırım, Ergün Poyraz, Ali Yasak, Hayrettin Ertekin; ikinci iddianamenin sanıklarından Mehmet Ufuk Büyükçelebi, Tuncay Özkan, Arif Doğan ve üçüncü iddianamenin sanıklarından Taylan Özgür Kırmızı, Hüseyin Buzoğlu, İbrahim Şahin, Mustafa Dönmez Ali Kalkancı'nın ismi var. Dönmez'de 4 ruhsatsız tabanca bulunurken, Sami Hoştan ve Mehmet Koral'da üçer tane ele geçmiş.
ve büyük harflerle yazılmış yorumlar onaylanmamaktadır.